V návaznosti na závěry a doporučení Národního akčního plánu rozvoje jaderné energetiky založila společnost ČEZ, a. s. v roce 2015 dceřinou společnost Elektrárna Dukovany II, a. s., která je investorem projektu nového jaderného zdroje v lokalitě Dukovany. Ve společnosti Elektrárna Dukovany II, a. s. je od počátku nastaven tzv. dualistický systém řízení, který je klasicky tvořen představenstvem a dozorčí radou, které mají mezi sebe rozděleny klíčové funkce, definované ve Statutu. Vrcholným orgánem je valná hromada, 80 % akcií společnosti vlastní Ministerstvo financí ČR a vlastníkem zbylých 20 % je společnost ČEZ, a. s. 

Představenstvo společnosti

Ing. Petr Závodský

Předseda představenstva 
Narozen 1970

Ing. Zbyněk Mrázek

Místopředseda představenstva od 3. 9. 2020
Narozen 1961

Mgr. Jan Fajt

Člen představenstva od 1. 8. 2020
Narozen 1977

Ing. Jiří Füzér

Člen představenstva od 1. 8. 2020
Narozen 1982

Ing. Pavel Kamenický

Člen představenstva od 1. 1. 2022
Narozen 1975

Dozorčí rada společnosti

Mgr. Veronika Peřinová

Předsedkyně dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozena 1974

Ing. Tomáš Pleskač

Místopředseda dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1966

PhDr. Tomáš Ehler, Ph.D., MBA

Místopředseda dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1981

doc. Mgr. Tomáš Holub, Ph.D.

Člen dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1974

Mgr. Ondřej Landa

Člen dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1980

Ing. David Prušvic, Ph.D.

Člen dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1979

Ing. Petr Třešňák 

Člen dozorčí rady od 13. 8. 2025
Narozen 1983